El Comando scp
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Para copiar archivos entre diferentes máquinas, sin necesidad de hacer un ftp, o un ssh y después un ftp, la mejor opción es usar el programa scp, obviamente debemos contar con una cuenta ssh en la máquina de destino. Lo único que hay que hacer es:
scp ruta/archivo/local usuario_remoto@maquina_remota:ruta_destino
Para copiar desde una máquina remota a nuestra máquina local:
scp usuario_remoto@maquina_remota:/ruta/archivo/remoto /ruta/destino/local
Para más información ver la página del manual para scp: man scp